mt:ND5 sequence #Kliman et al., 2000 Genetics 156: 1913-31 26 277 2 0 4 melanogaster 1 simulans 9 mauritiana 8 sechellia 8 ME CTTCTTGGTTACCTGCAGCTATAGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACATTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATCTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTAATATTATTATTATCTGGATTAACAATATTTATAGCTGGATTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SI1 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI2 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI3 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI4 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI5 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI6 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI7 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI8 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA SI9 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATAGCTGCCCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTATATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGGCAATTATTATTATTATTATCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTATCTATAGGATTTTTTAA MA1 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA MA2 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA MA3 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA MA4 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA MA5 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA MA7 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA MA8 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA MA9 CTTCTTGACTACCAGCAGCTATGGCTGCTCCTACACCTGTTTCTGCTTTAGTTCACTCTTCTACTTTAGTTAGAGCTGGTGTTTATTTATTAATTCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTGGGACAATTATTATTATTATTGTCTGGATTAACTATATTTATAGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTTAA SE1 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SE2 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SE3 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SE4 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SE5 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGATTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SE6 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SE7 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA SE8 CTTCTTGATTACCAGCAGCTATGGCTGCCCCTACTCCTGTTTCTGCTTTAGTTCATTCTTCTACTTTAGTCAGAGCTGGTGTATATTTATTAATCCGATTTAATATTATTTTAAGAACTTCTTGGTTAGGACAATTATTATTGTTATTATCTGGATTAACTATATTTATGGCTGGGTTAGGAGCTAATTTTGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGTCAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTGTCTATAGGATTTTTAAA